Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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