Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PIAS3Q9Y6X2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIAS3Q9Y6X2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms