Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms