Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNSTRNQ9Y448 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms