Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
POMPQ9Y244 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
POMPQ9Y244 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
POMPQ9Y244 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
POMPQ9Y244 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms