Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms