Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE0

EDAR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member EDAR, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDARQ9UNE0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDARQ9UNE0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EDARQ9UNE0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EDARQ9UNE0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EDARQ9UNE0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EDARQ9UNE0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EDARQ9UNE0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDARQ9UNE0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDARQ9UNE0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDARQ9UNE0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDARQ9UNE0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDARQ9UNE0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDARQ9UNE0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDARQ9UNE0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDARQ9UNE0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDARQ9UNE0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EDARQ9UNE0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDARQ9UNE0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDARQ9UNE0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDARQ9UNE0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDARQ9UNE0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms