Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms