Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms