Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms