Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRP68Q9UHB9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms