Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms