Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms