Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms