Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
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