Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN3Q9P232 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms