Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms