Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms