Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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