Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK1Q9NYA1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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