Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms