Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms