Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOMER3Q9NSC5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms