Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms