Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms