Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms