Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068733.1-201ENST00000532430 1288 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353770.4-202ENST00000621296 1126 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 BX005040.1-201ENST00000622281 1126 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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