Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms