Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms