Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C2orf88Q9BSF0 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms