Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms