Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms