Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms