Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBL7Q96S82 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBL7Q96S82 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBL7Q96S82 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBL7Q96S82 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBL7Q96S82 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBL7Q96S82 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBL7Q96S82 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBL7Q96S82 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBL7Q96S82 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBL7Q96S82 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBL7Q96S82 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBL7Q96S82 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBL7Q96S82 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBL7Q96S82 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBL7Q96S82 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBL7Q96S82 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBL7Q96S82 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBL7Q96S82 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBL7Q96S82 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms