Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC85AQ96PX6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC85AQ96PX6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC85AQ96PX6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC85AQ96PX6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC85AQ96PX6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC85AQ96PX6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85AQ96PX6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85AQ96PX6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85AQ96PX6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85AQ96PX6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85AQ96PX6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85AQ96PX6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85AQ96PX6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85AQ96PX6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85AQ96PX6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85AQ96PX6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85AQ96PX6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85AQ96PX6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85AQ96PX6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms