Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.6 ms