Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms