Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms