Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGBD1Q96JS3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms