Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms