Protein–RNA interactions for Protein: Q969D9

TSLP, Thymic stromal lymphopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSLPQ969D9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSLPQ969D9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms