Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTP4A1Q93096 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTP4A1Q93096 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PTP4A1Q93096 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PTP4A1Q93096 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PTP4A1Q93096 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PTP4A1Q93096 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PTP4A1Q93096 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A1Q93096 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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