Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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GCN1Q92616 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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GCN1Q92616 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCN1Q92616 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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GCN1Q92616 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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GCN1Q92616 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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GCN1Q92616 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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GCN1Q92616 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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GCN1Q92616 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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GCN1Q92616 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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GCN1Q92616 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCN1Q92616 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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