Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms