Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPBAR1Q8TDU6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPBAR1Q8TDU6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms