Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGDNQ8NEJ9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NGDNQ8NEJ9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms