Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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