Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM35BQ8NCS4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms