Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms