Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP4Q8N2S1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms